{"id":1171,"date":"2015-10-06T14:14:43","date_gmt":"2015-10-06T13:14:43","guid":{"rendered":"http:\/\/www.nosoinfo.be\/nosoinfos\/?p=1171"},"modified":"2015-10-06T14:14:43","modified_gmt":"2015-10-06T13:14:43","slug":"contribution-a-la-maitrise-de-la-septicemie-sur-catheter-aspects-microbiologiques","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.nosoinfo.be\/nosoinfos\/contribution-a-la-maitrise-de-la-septicemie-sur-catheter-aspects-microbiologiques\/","title":{"rendered":"Contribution \u00e0 la ma\u00eetrise de la septic\u00e9mie sur cath\u00e9ter : aspects microbiologiques"},"content":{"rendered":"

\"Staphylococcus-epidermids\"<\/a><\/b><\/p>\n

Avant-propos <\/b><\/h2>\n

Cet article original reprend une partie des donn\u00e9es pr\u00e9sent\u00e9es dans le cadre d\u2019une th\u00e8se de doctorat en sciences m\u00e9dicales d\u00e9fendue le 28\/11\/2014 \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 Libre de Bruxelles, intitul\u00e9e \u00abContribution \u00e0 la ma\u00eetrise de la septic\u00e9mie sur cath\u00e9ter \u00e0 Staphylococcus epidermidis\u00bb (promoteur : Pr Baudouin Byl, co-promoteur : Pr Marie Hallin).\u00a0<\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9<\/b><\/h2>\n

Ces travaux apportent des \u00e9l\u00e9ments contribuant \u00e0 une meilleure connaissance de S. epidermidis<\/i> comme l\u2019existence de clones combinant multi-r\u00e9sistance et virulence particuli\u00e8rement bien adapt\u00e9s \u00e0 l\u2019environnement hospitalier, du possible impact des voies de contamination extra et endo-luminales sur les d\u00e9lais de contamination et sur la nature des S. epidermidis<\/i> impliqu\u00e9s, ainsi que sur la possible contribution des soignants dans la pathog\u00e9n\u00e8se de la CLABSI (septic\u00e9mie associ\u00e9e \u00e0 un cath\u00e9ter).<\/p>\n

Introduction<\/b><\/h2>\n

La CLABSI est une infection nosocomiale fr\u00e9quente, s\u00e9rieuse et largement \u00e9vitable, ce qui a pour cons\u00e9quence de la proposer comme indicateur de la qualit\u00e9 des soins.\u00a0<\/p>\n

S. epidermidis<\/i> est un germe commensal qui peut se r\u00e9v\u00e9ler \u00eatre un pathog\u00e8ne important \u00e0 l\u2019origine de nombreuses infections associ\u00e9es aux soins de sant\u00e9, comme les septic\u00e9mies sur cath\u00e9ter. Ces CLABSI sont la cause la plus fr\u00e9quente d\u2019infections acquises aux soins intensifs et entra\u00eenent une morbidit\u00e9 importante, un allongement des dur\u00e9es de s\u00e9jour et une augmentation des co\u00fbts (Tacconelli et al., 2009).\u00a0 Un faisceau d\u2019arguments \u00e0 la fois physiopathologiques (tels que la production de biofilm et la multi-r\u00e9sistance aux antibiotiques) et \u00e9pid\u00e9miologiques (tels que les \u00e9tudes prouvant l\u2019efficacit\u00e9 des mesures de pr\u00e9vention sur l\u2019incidence de septic\u00e9mies sur cath\u00e9ter) souligne l\u2019importance d\u2019approfondir la connaissance des \u00e9l\u00e9ments sp\u00e9cifiques \u00e0 la pathog\u00e9nicit\u00e9 des S. epidermidis <\/i>mais aussi de concevoir de nouvelles strat\u00e9gies de pr\u00e9vention.\u00a0<\/p>\n

Au d\u00e9part de notre r\u00e9flexion, nous avons observ\u00e9 dans une premi\u00e8re \u00e9tude sur la prise en charge th\u00e9rapeutique et le pronostic des septic\u00e9mies sur TIVAD (Totally implantable venous access device<\/i>), qu\u2019en cas d\u2019infections caus\u00e9es par
S. epidermidis<\/i>, les pr\u00e9sentations cliniques \u00e9taient tr\u00e8s variables. Cependant, seules les pr\u00e9sences d\u2019un sepsis d\u2019embl\u00e9e et de signes locaux d\u2019infection \u00e9taient statistiquement associ\u00e9es \u00e0 un risque d\u2019\u00e9chec de l\u2019option th\u00e9rapeutique visant au maintien du TIVAD en place, alors que ni le d\u00e9lai d\u2019infection, ni le site d\u2019implantation du TIVAD, ni le type d\u2019usage de celui-ci, ni certaines caract\u00e9ristiques propres au patient ne l\u2019\u00e9taient (Cherifi et al., 2007). Ceci sugg\u00e8re que des caract\u00e9ristiques microbiologiques ph\u00e9notypiques (antibio-r\u00e9sistance) et\/ou g\u00e9notypiques (facteurs de virulence, lign\u00e9e g\u00e9n\u00e9tique) de S. epidermidis pourraient jouer un r\u00f4le central dans la pathog\u00e9nie de la septic\u00e9mie sur cath\u00e9ter. Par ailleurs, les informations disponibles \u00e0 ce jour en terme d\u2019\u00e9pid\u00e9miologie mol\u00e9culaire tant sur les souches communautaires qu\u2019hospitali\u00e8res de\u00a0 S. epidermidis en Belgique sont limit\u00e9es ou proviennent de travaux de m\u00e9decine v\u00e9t\u00e9rinaire (Deplano et al., 1997; Piessens et al., 2011; Vanderhaeghen et al., 2012). \u00a0<\/p>\n

Nous avons \u00e9tudi\u00e9 diff\u00e9rentes sous-populations de
S. epidermidis<\/i>: souches commensales de volontaires sains, souches colonisant les mains du personnel soignant et souches responsables de CLABSI. L\u2019id\u00e9e \u00e9tait de contribuer \u00e0 identifier d\u2019\u00e9ventuelles caract\u00e9ristiques ph\u00e9notypiques et g\u00e9notypiques sp\u00e9cifiques aux S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI et de surcro\u00eet, de corr\u00e9ler ces donn\u00e9es \u00e0 des donn\u00e9es cliniques de s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de pr\u00e9sentation clinique.\u00a0<\/p>\n

S\u00e9lection des souches\u00a0<\/b><\/h2>\n

Au total, 128 souches de S. epidermidis<\/i> ont \u00e9t\u00e9 \u00e9tudi\u00e9es.\u00a0<\/p>\n

Cinquante-trois souches cliniques de S. epidermidis<\/i>, issues de la souchoth\u00e8que du laboratoire de microbiologie de l\u2019h\u00f4pital Erasme proviennent de patients ayant \u00e9t\u00e9 hospitalis\u00e9s dans ce m\u00eame h\u00f4pital. Ces patients ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9s r\u00e9trospectivement dans la base de donn\u00e9es de la Clinique d\u2019Epid\u00e9miologie et d\u2019Hygi\u00e8ne Hospitali\u00e8re comme ayant pr\u00e9sent\u00e9 une CLABSI entre 2006 et 2012 (n = 33 sur la p\u00e9riode 2006-2011 et n = 20 sur la p\u00e9riode 2011-2012).<\/p>\n

Trente-trois souches commensales de S. epidermidis<\/i> ont \u00e9t\u00e9 collect\u00e9es prospectivement en 2011 sur frottis, de la peau situ\u00e9e \u00e0 la base du cou, de volontaires sains. Ces volontaires \u00e9taient des \u00e9tudiants de premier bachelor en m\u00e9decine de l\u2019ULB n\u2019ayant pas eu de contact r\u00e9cent avec le milieu hospitalier et n\u2019ayant pas pris d\u2019antibiotiques au cours des 3 mois pr\u00e9c\u00e9dents le pr\u00e9l\u00e8vement.\u00a0<\/p>\n

Enfin, 42 souches de S. epidermidis<\/i> ont \u00e9t\u00e9 prospectivement collect\u00e9es en 2012 par empreinte des doigts de la main dominante du personnel infirmier de l\u2019h\u00f4pital Erasme dans les dix unit\u00e9s d\u2019hospitalisation o\u00f9 les taux de CLABSI rapport\u00e9s sont les plus \u00e9lev\u00e9s (principalement les d\u00e9partements de soins intensifs et de gastroent\u00e9rologie).\u00a0<\/p>\n

R\u00e9sultats<\/b><\/h2>\n

Le d\u00e9tail des r\u00e9sultats est repris dans les articles originaux publi\u00e9s ci-dessous. Voici les r\u00e9sum\u00e9s des articles.\u00a0<\/p>\n

Cherifi S, Byl B, Deplano A, Nonhoff C, Denis O, Hallin M.\u00a0<\/i><\/p>\n

Comparative epidemiology of Staphylococcus epidermidis <\/i>isolates from patients with catheter-related bacteremia and from healthy volunteers<\/b>.\u00a0<\/p>\n

J Clin Microbiol. 2013 May;51(5):1541-7<\/p>\n

Nous avons observ\u00e9 que les S. epidermidis<\/i> \u00e0 l\u2019origine de septic\u00e9mies sur cath\u00e9ter (CLABSI) sont beaucoup plus r\u00e9sistants \u00e0 l\u2019ensemble des antibiotiques test\u00e9s que ceux des volontaires sains en particulier \u00e0 la m\u00e9ticilline, \u00e0 l\u2019erythromycine, \u00e0 la ciprofloxacine et au trim\u00e9thoprim\/sulfamethoxazole. La cassette SCCmec IV (27%) est la plus fr\u00e9quente, suivie de la cassette SCCmec III (15%).\u00a0<\/p>\n

La maturation du biofilm, implique chez S. epidermidi<\/i>s la production de PIA (intercellular polysaccharide adhesin<\/i>), responsable de l\u2019\u00e9tablissement du contact inter-bact\u00e9rien et de l\u2019accumulation du biofilm. La synth\u00e8se de ce polysaccharide d\u00e9pend de l\u2019expression de l\u2019op\u00e9ron chromosomique ica (intercellular adhesin<\/i>).<\/p>\n

L\u2019op\u00e9ron ica est pr\u00e9sent plus fr\u00e9quemment dans les souches hospitali\u00e8res que dans les souches colonisant les volontaires sains (p<0.05).\u00a0<\/p>\n

L\u2019ACME (arginine catabolic mobile element<\/i>) est retrouv\u00e9 dans 76% des souches quelle que soit leur origine.\u00a0<\/p>\n

Les S. epidermidis<\/i> issus de ces deux populations sont tr\u00e8s vari\u00e9s et g\u00e9n\u00e9tiquement distincts avec seulement 23% de pulsotypes communs (voir Figure 1). Mais, ces S. epidermidis<\/i> sont partiellement li\u00e9s sur le plan phylog\u00e9n\u00e9tique, avec 5 MLST sur 12 identifi\u00e9s comme appartenant au m\u00eame complexe clonal CC7.<\/p>\n

Un tiers des patients ont pr\u00e9sent\u00e9 une clinique s\u00e9v\u00e8re. Ces patients avaient \u00e9t\u00e9 pour la plupart hospitalis\u00e9s les 3 mois pr\u00e9c\u00e9dents, avaient tous re\u00e7u des antibiotiques le mois auparavant (p<0.05) et pr\u00e9sentaient un plus long d\u00e9lai entre leur admission et l\u2019\u00e9pisode de septic\u00e9mie (p<0.05), en comparaison avec les patients avec une clinique peu s\u00e9v\u00e8re. \u00a0<\/p>\n

Nous avons observ\u00e9 que deux g\u00e9notypes proches (ST2 et SLV (single locus variant<\/i>) ST54), ica positif, mec positif et multi-r\u00e9sistants aux antibiotiques ne sont retrouv\u00e9s que dans le groupe des S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI, et sont de plus associ\u00e9es aux pr\u00e9sentations cliniques les plus s\u00e9v\u00e8res.<\/p>\n

Soraya Cherifi, Baudouin Byl, Ariane Deplano, Carole Nagant, Claire Nonhoff, Olivier Denis, and Marie Hallin<\/i><\/p>\n

Genetic characteristics and antimicrobial resistance of Staphylococcus epidermidis<\/i> isolated from patients with catheter-related bloodstream infections and from colonized healthcare workers in a Belgian hospital.\u00a0<\/b><\/p>\n

Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. 2014 Jun 4 ;13(1) :20 \u00a0<\/p>\n

A la recherche d\u2019un r\u00e9servoir hospitalier de S. epidermidis<\/i>, nous avons compar\u00e9 la flore pr\u00e9sente sur les mains de soignants avec des souches de S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI sur une m\u00eame p\u00e9riode de temps.\u00a0<\/p>\n

Nous avons observ\u00e9 que les S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI sont plus r\u00e9sistants aux 12 antibiotiques test\u00e9s que ceux pr\u00e9lev\u00e9s sur les mains des soignants sauf pour la m\u00e9ticilline, la p\u00e9nicilline, l\u2019\u00e9rythromycine et l\u2019acide fusidique. La cassette SCCmec<\/i> IV (44%) est la plus fr\u00e9quemment retrouv\u00e9e (voir Table 1).<\/p>\n

L\u2019op\u00e9ron ica<\/i> (intercellular adhesin<\/i>) est significativement plus souvent pr\u00e9sent dans les souches invasives que dans les souches colonisant le personnel soignant. Les souches ayant form\u00e9 un biofilm in vitro avec une biomasse importante sont majoritairement ica positives. Inversement, les souches ica n\u00e9gatives ne produisent pas de biofilm in vitro dans plus de 90% des cas.\u00a0<\/p>\n

Un tiers de l\u2019ensemble des S. epidermidis<\/i> est identique g\u00e9n\u00e9tiquement (par PFGE) entre ceux issus des soignants et ceux responsables de CLABSI. Ceci montre que les soignants peuvent servir de r\u00e9servoir de souches et\/ou de vecteur de transmission de d\u00e9terminants de la r\u00e9sistance aux antibiotiques, telle que la r\u00e9sistance \u00e0 la m\u00e9ticilline.<\/p>\n

D\u2019un point de vue \u00e9pid\u00e9miologique, les pulsotypes \u00e9pid\u00e9miques de S. epidermidis<\/i> communs aux 3 sous-populations (volontaires sains-CLABSI-personnel soignant) repr\u00e9sentent 1\/5 des souches, appartiennent \u00e0 4 MLST (ST153, ST130, ST89 et ST59), sont tr\u00e8s peu r\u00e9sistants aux antibiotiques et sont peu virulents.\u00a0<\/p>\n

Par contre, les souches ST2, multir\u00e9sistantes, mec<\/i>A positives, ica<\/i>A positives, exclusivement retrouv\u00e9es chez les patients avec CLABSI et souvent associ\u00e9es \u00e0 des pr\u00e9sentations cliniques s\u00e9v\u00e8res, ne sont retrouv\u00e9es ni chez les volontaires sains ni chez les soignants. Ces clones semblent particuli\u00e8rement adapt\u00e9s \u00e0 l\u2019environnement hospitalier.\u00a0<\/p>\n

Table 1. Antimicrobial resistance profiles and resistance (R)-encoding genes of S. epidermidis isolates collected from healthcare workers (HCWs; n =42) vs. S. epidermidis isolates causing catheter-related bloodstream infections (CRBSIs; n = 20)<\/strong>
\"06\"<\/a><\/p>\n

<\/i>Legend<\/i><\/b>:
No resistance to minocycline, vancomycin, linezolid, and tigecycline was observed.
\u00a7The three aminoglycosides were regarded as a whole, and isolates resistant to at least one of the three drugs were considered resistant to aminoglycosides.\u00a0
*For clindamycin, the values in square brackets represent the number of isolates with a clindamycin-inducible resistant phenotype.<\/p>\n

Discussion\u00a0<\/b><\/h2>\n

Nous avons d\u00e9montr\u00e9 que les souches hospitali\u00e8res de S. epidermidis<\/i> \u00e9tudi\u00e9es, issues des mains des soignants et responsables de CLABSI, sont r\u00e9sistantes \u00e0 plus d\u2019antibiotiques que les souches commensales qui circulent dans la communaut\u00e9 et que, les S. epidermidis<\/i> colonisant les volontaires sains sont multi-sensibles et presque toujours m\u00e9ticilline sensibles. De plus, les S. epidermidis<\/i> du personnel soignant sont statistiquement r\u00e9sistants \u00e0 un moins grand nombre d\u2019antibiotiques que ceux responsables de CLABSI, \u00e0 l\u2019exception de la m\u00e9ticilline. Ces r\u00e9sultats concordent avec ceux des quelques autres \u00e9tudes faites chez des sujets sains et sugg\u00e8rent fortement une association entre l\u2019antibior\u00e9sistance observ\u00e9e dans les souches hospitali\u00e8res et la pression de s\u00e9lection antibiotique, elle-m\u00eame li\u00e9e \u00e0 l\u2019usage abondant de ces mol\u00e9cules dans l\u2019environnement hospitalier (Li et al., 2009; Rolo et al., 2012).\u00a0<\/p>\n

Nous avons observ\u00e9 une grande vari\u00e9t\u00e9 au sein des cassettes SCCmec<\/i> port\u00e9es par les S. epidermidis<\/i> r\u00e9sistants \u00e0 la m\u00e9ticilline (MRSE) responsables de CLABSI chez des patients hospitalis\u00e9s et chez les soignants. La cassette SCCmec<\/i> IV est la plus fr\u00e9quemment identifi\u00e9e, suivie de la cassette SCCmec <\/i>III, comme d\u00e9crit dans d\u2019autres travaux (Otto, 2009; Du et al., 2013). Les souches de S. epidermidis<\/i> serviraient de r\u00e9servoirs de SCCmec <\/i>pour les S. aureus.<\/i>\u00a0<\/p>\n

L\u2019il\u00f4t ACME (arginine catabolic mobile elemen<\/i>t) est un \u00e9l\u00e9ment g\u00e9n\u00e9tique mobile initialement consid\u00e9r\u00e9 comme un facteur de virulence important \u00e0 cause de sa pr\u00e9sence dans la souche pathologique de S. aureus<\/i> USA300. Nous avons retrouv\u00e9 l\u2019ACME dans 2\/3 des souches de S. epidermidis analys\u00e9es, comme rapport\u00e9 dans d\u2019autres publications\u00a0 (Miragaia et al., 2009; Barbier et al., 2011) et ce quelle que soit l\u2019origine de ces souches, volontaires sains ou CLABSI. Bien qu\u2019il soit pr\u00e9sent dans la souche de MRSA USA300 (Diep et al., 2008), l\u2019ACME ne serait pas un facteur de virulence per se mais interviendrait pour favoriser la colonisation et la survie de S. epidermidis<\/i> sur la peau et en milieu acide.\u00a0<\/p>\n

Pour rappel, la production de PIA, polysaccharide indispensable \u00e0 la maturation du biofilm, est sous la d\u00e9pendance de l\u2019expression de l\u2019op\u00e9ron ica (intercellular adhesin<\/i>). Dans notre travail, l\u2019op\u00e9ron ica<\/i>A est significativement plus souvent retrouv\u00e9 dans les souches responsables de CLABSI que parmi celles isol\u00e9es des volontaires sains et des mains des soignants.\u00a0 De plus, la pr\u00e9sence d\u2019ica <\/i>est associ\u00e9e \u00e0 une pr\u00e9sentation clinique de CLABSI plus s\u00e9v\u00e8re. La majorit\u00e9 des souches de S. epidermidis<\/i> ayant une production importante de biofilm in vitro<\/i> sont porteuses de l\u2019op\u00e9ron ica <\/i>tandis que la majorit\u00e9 des souches de S. epidermidis<\/i> n\u2019en produisant pas sont ica n\u00e9gatives, ce qui est classiquement observ\u00e9 (Mertens and Ghebremedhin, 2013). Les souches productrices de biofilm, quelle que soit l\u2019intensit\u00e9 de la biomasse observ\u00e9e, sont retrouv\u00e9es dans les trois sous-populations et pas plus particuli\u00e8rement dans le sous-groupe des souches responsables de CLABSI.\u00a0<\/p>\n

En effet, nous avons observ\u00e9 que la d\u00e9tection de l\u2019op\u00e9ron ica <\/i>n\u2019est pas toujours associ\u00e9e \u00e0 la formation de biofilm in vitro. Plus surprenant, la majorit\u00e9 de ces souches \u00ab ica positive\/biofilm negative \u00bb appartiennent au sous-groupe des S. epidermidis <\/i>responsables de CLABSI. Dans la litt\u00e9rature, la production de biofilm in vitro est significativement plus importante parmi les souches responsables d\u2019infections par rapport aux souches de portage (Arciola et al., 2001; Kozitskaya et al., 2004; Du et al., 2013; Mertens and Ghebremedhin, 2013). Cette diff\u00e9rence avec nos observations pourrait \u00eatre attribu\u00e9e \u00e0 la nature de l\u2019\u00e9chantillonnage des souches chez les volontaires sains (g\u00e9n\u00e9ralement frottis de nez et non frottis de peau) et \u00e0 la diversit\u00e9 des sites d\u2019infection s\u00e9lectionn\u00e9s (infections urinaires, septic\u00e9mies, cath\u00e9ters). Mais, nos conditions exp\u00e9rimentales auraient peut-\u00eatre favoris\u00e9 l\u2019inactivation des g\u00e8nes ica. En effet, la formation du biofilm est multifactorielle et soumise \u00e0 une r\u00e9gulation complexe. Il est difficile d\u2019extrapoler la formation du biofilm in vivo au d\u00e9part des observations faites in vitro. Les conditions in vivo de stress, d\u2019oxyg\u00e9nation, de pH, de pr\u00e9sence d\u2019antibiotiques sont variables, influent sur la formation du biofilm et n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 reproduites lors des observations in vitro (Fitzpatrick et al., 2002). Les S. epidermidis<\/i> issus des trois sous-populations \u00e9tudi\u00e9es sont tr\u00e8s vari\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiquement (par PFGE) avec seulement 1\/5 des pulsotypes communs aux trois populations, sont tr\u00e8s peu r\u00e9sistants aux antibiotiques et sont peu virulents. Cette grande diversit\u00e9 a \u00e9t\u00e9 rapport\u00e9e dans d\u2019autres travaux, tant dans l\u2019environnement hospitalier que dans la communaut\u00e9 (Bogado et al., 2002; Nunes et al., 2005; Rolo et al., 2012). Elle souligne la capacit\u00e9 d\u2019adaptation des isolats de S. epidermidis \u00e0 des environnements tr\u00e8s diff\u00e9rents (Miragaia et al., 2007). Par contre, ces populations distinctes sont partiellement li\u00e9es sur le plan phylog\u00e9n\u00e9tique puisque la majorit\u00e9 des clones \u00e9pid\u00e9miques issus tant de la communaut\u00e9 que de l\u2019environnement hospitalier appartiennent \u00e0 un m\u00eame complexe clonal (CC), le CC2 pr\u00e9c\u00e9demment d\u00e9crit (Rolo et al., 2012). Deux clones particuliers (ST2 et le SLV (single locus variant) ST54) ne sont retrouv\u00e9s que dans le groupe de S. epidermidis r<\/i>esponsables de CLABSI. Les isolats de type ST2 repr\u00e9sentent environ 20% de l\u2019ensemble des S. epidermidis <\/i>issus des CLABSI ce qui est un peu moins que dans la litt\u00e9rature o\u00f9 ils repr\u00e9sentent le principal groupe responsable d\u2019infections nosocomiales (de toutes origines : urinaire, mat\u00e9riel infect\u00e9\u2026). Ce clone, essentiellement hospitalier, est retrouv\u00e9 partout dans le monde tant aux Etats-Unis, en Australie, en Chine qu\u2019en Europe du nord (Widerstrom et al., 2009; Gordon et al., 2012; Widerstrom et al., 2012; Du et al., 2013). Il semble avoir acquis un potentiel \u00e9pid\u00e9mique et de virulence qui lui permet de diffuser dans le milieu hospitalier.<\/p>\n

Les S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI appartenant \u00e0 ST2 et \u00e0 SLV ST54 (dits \u00ab hospitaliers \u00bb) sont responsables de cliniques plus s\u00e9v\u00e8res que les autres S. epidermidis. <\/i>Inversement, les S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI \u00e0 pr\u00e9sentation clinique moins s\u00e9v\u00e8re et appartenant \u00e0 des pulsotypes observ\u00e9s chez les volontaires sains sont ica <\/i>n\u00e9gatifs, ce qui tend \u00e0 d\u00e9montrer que ces souches, moins virulentes, sont probablement d\u2019origine communautaire. En plus des facteurs li\u00e9s \u00e0 l\u2019h\u00f4te, il pourrait d\u00e8s lors exister une association entre le type g\u00e9n\u00e9tique de S. epidermidis<\/i> et la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de l\u2019infection.\u00a0<\/p>\n

Dans notre \u00e9tude, 1\/3 de l\u2019ensemble des souches de S. epidermidis<\/i> isol\u00e9es parmi les membres du personnel soignant et ceux responsables des CLABSI partagent les m\u00eames pulsotypes. Ces clones communs appartiennent, par MLST, aux ST22 et ST5. Cette observation nous permet de dire que les soignants pourraient servir au moins partiellement de vecteur \u00e0 des S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI. Par contre les clones ST2 et ST54, exclusivement retrouv\u00e9s chez les S. epidermidis<\/i> responsables de CLABSI et associ\u00e9s aux cliniques les plus s\u00e9v\u00e8res, ne sont pas retrouv\u00e9s sur les mains des soignants. Cependant, en dehors d\u2019un contexte \u00e9pid\u00e9mique, la CLABSI reste un \u00e9v\u00e9nement rare. Le hasard de l\u2019\u00e9chantillonnage pourrait expliquer nos r\u00e9sultats : soit les soignants ne sont que des porteurs transitoires de souches de S. epidermidis<\/i> \u00ab hospitaliers \u00bb, comme dans le mod\u00e8le manuport\u00e9 de la transmission des MRSA hospitaliers ou soit ce sont des porteurs chroniques mais qui pourraient perdre cette flore particuli\u00e8re apr\u00e8s une certaine p\u00e9riode en dehors de l\u2019h\u00f4pital, comme d\u00e9montr\u00e9 dans d\u2019autres travaux (Hira et al<\/i>., 2010).\u00a0<\/p>\n

Le r\u00e9servoir de S. epidermidis<\/i> \u00e0 l\u2019origine de septic\u00e9mies sur cath\u00e9ters ne se limite pas aux mains du personnel soignant. Dans la litt\u00e9rature, des infections par SCN transmises au d\u00e9part du personnel soignant mais aussi entre patients ont \u00e9t\u00e9 rapport\u00e9es (Milisavljevic et al., 2005; Liakopoulos et al., 2008). L\u2019environnement hospitalier, comme les surfaces, peut servir de r\u00e9servoir de S. epidermidis<\/i> pathog\u00e8nes (Kelly et al., 2008). L\u2019air pourrait \u00e9galement jouer un r\u00f4le de r\u00e9servoir ou intervenir dans la transmission des S. epidermidis<\/i>. En effet, des SCN identiques par pulsotypage ont \u00e9t\u00e9 retrouv\u00e9s dans des pr\u00e9l\u00e8vements d\u2019air \u00e0 l\u2019h\u00f4pital et sur des patients (Botelho et al., 2012) et m\u00eame dans l\u2019air des domiciles de personnes fr\u00e9quentant l\u2019h\u00f4pital (Lis et al., 2009). Ces hypoth\u00e8ses n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 investigu\u00e9es dans ce travail et auraient n\u00e9cessit\u00e9 des pr\u00e9l\u00e8vements de surfaces et d\u2019air pour pouvoir, non seulement prouver la pr\u00e9sence de S. epidermidis<\/i>, mais surtout \u00e9tudier le r\u00f4le de la transmission a\u00e9rienne dans leur diss\u00e9mination.<\/p>\n

Il existe classiquement deux voies principales d\u2019acquisition d\u2019une septic\u00e9mie sur cath\u00e9ter : la voie extra-luminale, impliqu\u00e9e dans les \u00e9pisodes survenant surtout la premi\u00e8re semaine de placement du cath\u00e9ter, et la voie endo-luminale. La premi\u00e8re voie se d\u00e9velopperait \u00e0 partir des S. epidermidis<\/i> appartenant \u00e0 la flore commensale de la peau du patient et la seconde voie impliquerait plus volontiers des S. epidermidis<\/i> issus de
\u00ab l\u2019environnement hospitalier \u00bb. Dans nos travaux, les patients avec des CLABSI dues \u00e0 des S. epidermidis<\/i>, appartenant \u00e0 des g\u00e9notypes hospitaliers, ont des dur\u00e9es d\u2019hospitalisation significativement plus longues (26 jours versus 13 jours) que ceux appartenant \u00e0 des g\u00e9notypes communautaires. Ce sont essentiellement des patients ayant \u00e9t\u00e9 expos\u00e9s \u00e0 des antibiotiques le mois pr\u00e9c\u00e9dent et qui ont des cath\u00e9ters ins\u00e9r\u00e9s depuis longtemps. Les CLABSI observ\u00e9es plus tardivement au cours de l\u2019hospitalisation et\/ou de la \u00ab vie \u00bb du cath\u00e9ter sont le plus souvent dues \u00e0 des souches de S. epidermidis ica<\/i> positives, souvent mec<\/i>A postives, souvent multi-r\u00e9sistante, souvent ST2 et \u00e0 pr\u00e9sentation clinique s\u00e9v\u00e8re, ce qui confirme leur origine plut\u00f4t hospitali\u00e8re. Ces S. epidermidis<\/i> seraient persistants dans l\u2019environnement hospitalier comme d\u00e9j\u00e0 d\u00e9crit dans la litt\u00e9rature pour les SCN (Neely and Maley, 2000; Widerstrom et al., 2006) et pourraient \u00eatre transmis via les manipulations du cath\u00e9ter par contact avec les mains du personnel soignant. Ces S. epidermidis<\/i> hospitaliers coloniseraient ensuite le patient en formant une nouvelle flore cutan\u00e9e, qui pourrait \u00e0 son tour \u00eatre responsable d\u2019une contamination extra-luminale lors de la mise en place d\u2019un cath\u00e9ter en cours d\u2019hospitalisation ou de la r\u00e9fection d\u2019un pansement.\u00a0<\/p>\n

Pour \u00e9tayer cette hypoth\u00e8se, il pourrait \u00eatre int\u00e9ressant de r\u00e9aliser des frottis de peau chez des patients durant leur hospitalisation pour y d\u00e9tecter une modification de leur flore, la vitesse \u00e0 laquelle elle survient, l\u2019acquisition \u00e9ventuelle d\u2019une flore de S. epidermidis<\/i>, ica<\/i> positive et multi-r\u00e9sistante aux antibiotiques, et enfin l\u2019influence de la prise d\u2019antibiotiques sur cette dynamique comme d\u00e9montr\u00e9 sur un cas clinique bien document\u00e9. Chez ce patient hospitalis\u00e9, la composition de sa flore cutan\u00e9e s\u2019est modifi\u00e9e progressivement, de souches de S. epidermidis<\/i> avec des profils g\u00e9notypiques vari\u00e9s et multi-sensibles aux antibiotiques, vers une seule souche particuli\u00e8re de S. epidermidis<\/i> multi-r\u00e9sistante et virulente. Ce patient a ensuite pr\u00e9sent\u00e9 plusieurs \u00e9pisodes successifs de CLABSI dues \u00e0 ces S. epidermidis<\/i> diff\u00e9rents (Blum-Menezes et al., 2009).\u00a0<\/p>\n

Une autre hypoth\u00e8se serait que les souches de S. epidermidis <\/i>plus virulentes seraient moins pr\u00e9sentes sur la peau car, pour les bact\u00e9ries, du point de vue de leur capacit\u00e9 \u00e0 se reproduire, ce serait moins avantageux de produire du biofilm (notion de fitness cost<\/i>). Elles seraient donc pr\u00e9sentes en moins grand nombre sur la peau et auraient \u00e9chapp\u00e9 \u00e0 notre prise d\u2019\u00e9chantillons par frottis de cou ou empreintes de doigts alors qu\u2019inversement, elles coloniseraient pr\u00e9f\u00e9rentiellement le mat\u00e9riel. Il y aurait donc un biais de s\u00e9lection dans les S. epidermidis compar\u00e9s sachant que, dans la technique utilis\u00e9e dans nos travaux, seule une souche par pr\u00e9l\u00e8vement a \u00e9t\u00e9 analys\u00e9e.\u00a0<\/p>\n

Conclusion<\/b><\/h2>\n

Nous avons montr\u00e9 que les S. epidermidis <\/i>pr\u00e9sentent une grande diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique et ont une antibio-r\u00e9sistance tr\u00e8s diff\u00e9rente en fonction du fait qu\u2019ils colonisent la peau des volontaires sains, les mains du personnel soignant ou qu\u2019ils causent une septic\u00e9mie. Nous avons relev\u00e9 une grande diversit\u00e9 dans les cassettes SCCmec identifi\u00e9es, ce qui refl\u00e8te la grande flexibilit\u00e9 de leur g\u00e9nome.\u00a0 Nous avons \u00e9galement relev\u00e9 que la pr\u00e9sence du g\u00e8ne ica<\/i>A est significativement plus fr\u00e9quente chez les S. epidermidis\u00a0<\/i> responsables de CLABSI que chez les souches commensales. Par contre, l\u2019ilot ACME indiff\u00e9remment pr\u00e9sent dans 2\/3 de nos souches, n\u2019aurait pas de r\u00f4le dans la pathog\u00e9nicit\u00e9 de S. epidermidis. Nous avons observ\u00e9 qu\u2019un tiers des souches de S. epidermidis<\/i> isol\u00e9es sur les mains du personnel soignant sont g\u00e9n\u00e9tiquement identiques \u00e0 certaines souches responsables de CLABSI et que le personnel soignant peut donc servir de r\u00e9servoir de souches de S. epidermidis<\/i> pathog\u00e8nes et r\u00e9sistantes. De plus, nous avons observ\u00e9 que les pr\u00e9sentations cliniques les plus s\u00e9v\u00e8res de CLABSI sont associ\u00e9es \u00e0 des S. epidermidis<\/i> appartenant sp\u00e9cifiquement \u00e0 une lign\u00e9e g\u00e9n\u00e9tique particuli\u00e8re (ST2 et SLV ST54), tous icaA positifs, mecA positifs et multi-r\u00e9sistants aux antibiotiques, et que nous ne l\u2019avons retrouv\u00e9 ni chez les volontaires sains ni sur les mains du personnel soignant. Les S. epidermidis gros producteurs de biofilm sont ica positifs et la plupart des souches ica<\/i> n\u00e9gatives ne produisent pas de biofilm. Mais la pr\u00e9sence de l\u2019op\u00e9ron ica<\/i>A n\u2019est pas toujours associ\u00e9e \u00e0 la formation de biofilm in vitro<\/i>, en particulier chez les souches responsables de CLABSI. Les deux voies principales endoluminale et extraluminale, impliqu\u00e9es dans la pathog\u00e9n\u00e8se de la CLABSI \u00e0 S. epidermidis<\/i>, doivent \u00eatre consid\u00e9r\u00e9es simultan\u00e9ment dans une d\u00e9marche pratique de pr\u00e9vention des infections de cath\u00e9ters.<\/p>\n

\u00a0\"Diapositive<\/a><\/p>\n

\"tab-legende\"<\/a><\/p>\n

R\u00e9f\u00e9rences<\/b><\/h2>\n

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